头发移植手术如果由一位有资质的、经验丰富的医生执刀一般是安全的。然而,由于受术者的身体反应和康复能力非常不同,因此手术结果并不能完全准确地预计。
象任何手术一样,头发移植手术也有可能出现感染。大出血和/或大疤痕,有时称为“撑缩(stretch-back)”疤痕是由于一些头皮缩减手术形成的拉力而导致的。
在移植手术中,存在一种风险是一些移植物不能“取走”。尽管包含在毛囊(plug)中的头发在新址种植后、重新生长之前脱落是正常现象,但是有时头皮毛囊会死亡,因此手术必须重新再做。
有时,毛囊移植的受术者会注意到头皮上的小肿块会在移植区域形成。这些区域一般可以用周围的头发进行掩饰。